Nestes ensaios, e numa primeira etapa, são recolhidas todas as informações disponíveis sobre a cultura, sintomas, bibliografia, etc. por forma definir uma estratégia de amostragem e ensaio. A identificação de bactérias causadores de doenças em plantas é realizada através do isolamento em meios convencionais e/ou seletivos, seguida de identificação molecular. Para algumas culturas não há descrição bibliográfica da existência de bactérias fitopatogénicas específicas. Nestes casos é necessário adotar estratégias que não passam pelo isolamento.