O IPN promove atividades de inovação e apoio ao empreendedorismo de base tecnológica, tais como a coordenação e participação em projetos europeus e nacionais, apoio em questões de propriedade intelectual, organização de programas de aceleração de ideias de negócio e atividades de fomento de inovação interna para empresas e outras organizações.

Destaca-se a sua parceria com a Agência Espacial Europeia (ESA), com o programa ESA Space Solutions Portugal de dinamização da economia do espaço, programas de incubação, gestão de financiamentos e brokerage tecnológico, e com a NATO através do programa DIANA.